Karlsøy sykehjem har tre pasientavdelinger, i tillegg til støttetjenester som kjøkken, vaskeri og renhold. Etter endring av organiseringen, er det nå nyopprettede stilling som avdelingsleder på en av pasientavdelingene. Avdelingslederene har ansvar for fag og personal på sin avdeling. Dette gjøres for å styrke nærværsledelse, personaloppfølging, rekruttering og faglig utvikling. Avdelingslederne inngår i ledergruppe med virksomhetsleder, og med ledere på tvers av avdelingene i kommunen.